Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms