Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRBNQ96SW2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms