Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIN3AQ96ST3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms