Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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SGF29Q96ES7 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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