Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms