Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU4

FDCSP, Follicular dendritic cell secreted peptide, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDCSPQ8NFU4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FDCSPQ8NFU4 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FDCSPQ8NFU4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FDCSPQ8NFU4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FDCSPQ8NFU4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FDCSPQ8NFU4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FDCSPQ8NFU4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FDCSPQ8NFU4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FDCSPQ8NFU4 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FDCSPQ8NFU4 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FDCSPQ8NFU4 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FDCSPQ8NFU4 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FDCSPQ8NFU4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FDCSPQ8NFU4 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FDCSPQ8NFU4 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FDCSPQ8NFU4 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FDCSPQ8NFU4 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FDCSPQ8NFU4 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FDCSPQ8NFU4 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FDCSPQ8NFU4 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FDCSPQ8NFU4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FDCSPQ8NFU4 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FDCSPQ8NFU4 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FDCSPQ8NFU4 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FDCSPQ8NFU4 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FDCSPQ8NFU4 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FDCSPQ8NFU4 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FDCSPQ8NFU4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FDCSPQ8NFU4 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FDCSPQ8NFU4 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms