Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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RAB11FIP4Q86YS3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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RAB11FIP4Q86YS3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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RAB11FIP4Q86YS3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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RAB11FIP4Q86YS3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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RAB11FIP4Q86YS3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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RAB11FIP4Q86YS3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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RAB11FIP4Q86YS3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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RAB11FIP4Q86YS3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB11FIP4Q86YS3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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