Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CATSPER4Q7RTX7 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CATSPER4Q7RTX7 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms