Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms