Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT80Q6KB66 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms