Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms