Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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