Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SS18Q15532 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SS18Q15532 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms