Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARHGEF6Q15052 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms