Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPTAN1Q13813 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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