Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms