Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms