Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms