Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE3AQ05086 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms