Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms