Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms