Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
RPS29P62273 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
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