Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FNTBP49356 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTBP49356 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTBP49356 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTBP49356 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTBP49356 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTBP49356 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTBP49356 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTBP49356 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTBP49356 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTBP49356 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTBP49356 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTBP49356 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTBP49356 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTBP49356 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTBP49356 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTBP49356 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTBP49356 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTBP49356 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTBP49356 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTBP49356 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTBP49356 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTBP49356 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms