Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CRATP43155 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRATP43155 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRATP43155 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRATP43155 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRATP43155 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRATP43155 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRATP43155 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRATP43155 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRATP43155 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRATP43155 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRATP43155 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRATP43155 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRATP43155 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRATP43155 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRATP43155 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRATP43155 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRATP43155 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRATP43155 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRATP43155 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRATP43155 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRATP43155 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRATP43155 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CRATP43155 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRATP43155 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRATP43155 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRATP43155 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CRATP43155 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CRATP43155 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRATP43155 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRATP43155 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRATP43155 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRATP43155 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRATP43155 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRATP43155 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRATP43155 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CRATP43155 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRATP43155 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRATP43155 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRATP43155 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRATP43155 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRATP43155 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRATP43155 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRATP43155 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRATP43155 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms