Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MDH1P40925 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MDH1P40925 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MDH1P40925 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms