Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARGP37231 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms