Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TGFBR1P36897 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms