Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CHRNA7P36544 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms