Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms