Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB2P29033 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GJB2P29033 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GJB2P29033 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GJB2P29033 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GJB2P29033 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GJB2P29033 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GJB2P29033 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GJB2P29033 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GJB2P29033 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GJB2P29033 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GJB2P29033 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GJB2P29033 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GJB2P29033 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GJB2P29033 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GJB2P29033 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GJB2P29033 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GJB2P29033 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GJB2P29033 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GJB2P29033 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GJB2P29033 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GJB2P29033 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GJB2P29033 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GJB2P29033 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GJB2P29033 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GJB2P29033 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GJB2P29033 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GJB2P29033 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GJB2P29033 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GJB2P29033 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GJB2P29033 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GJB2P29033 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GJB2P29033 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GJB2P29033 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GJB2P29033 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GJB2P29033 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GJB2P29033 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GJB2P29033 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GJB2P29033 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GJB2P29033 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GJB2P29033 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GJB2P29033 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GJB2P29033 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GJB2P29033 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GJB2P29033 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GJB2P29033 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GJB2P29033 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GJB2P29033 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GJB2P29033 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GJB2P29033 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms