Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms