Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHGAP10645 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHGAP10645 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHGAP10645 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHGAP10645 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHGAP10645 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHGAP10645 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHGAP10645 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHGAP10645 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHGAP10645 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHGAP10645 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHGAP10645 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHGAP10645 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHGAP10645 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHGAP10645 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHGAP10645 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHGAP10645 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHGAP10645 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHGAP10645 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHGAP10645 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHGAP10645 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHGAP10645 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHGAP10645 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHGAP10645 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHGAP10645 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHGAP10645 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHGAP10645 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHGAP10645 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHGAP10645 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHGAP10645 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHGAP10645 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHGAP10645 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHGAP10645 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHGAP10645 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHGAP10645 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHGAP10645 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHGAP10645 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHGAP10645 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHGAP10645 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHGAP10645 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHGAP10645 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHGAP10645 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHGAP10645 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHGAP10645 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHGAP10645 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHGAP10645 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHGAP10645 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHGAP10645 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHGAP10645 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHGAP10645 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHGAP10645 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHGAP10645 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHGAP10645 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHGAP10645 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHGAP10645 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHGAP10645 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHGAP10645 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHGAP10645 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHGAP10645 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHGAP10645 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHGAP10645 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHGAP10645 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHGAP10645 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHGAP10645 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHGAP10645 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHGAP10645 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHGAP10645 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHGAP10645 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHGAP10645 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHGAP10645 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHGAP10645 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHGAP10645 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHGAP10645 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHGAP10645 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHGAP10645 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHGAP10645 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHGAP10645 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHGAP10645 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHGAP10645 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHGAP10645 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHGAP10645 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHGAP10645 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHGAP10645 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHGAP10645 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHGAP10645 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHGAP10645 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHGAP10645 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHGAP10645 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHGAP10645 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHGAP10645 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHGAP10645 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHGAP10645 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHGAP10645 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHGAP10645 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHGAP10645 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHGAP10645 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHGAP10645 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHGAP10645 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHGAP10645 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHGAP10645 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms