Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APODP05090 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms