Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNSO60931 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNSO60931 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNSO60931 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNSO60931 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNSO60931 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNSO60931 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNSO60931 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNSO60931 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNSO60931 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNSO60931 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNSO60931 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNSO60931 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms