Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD8O14715 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms