Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms