Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC169A6NNP5 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms