Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS03

TRBV5-3, T-cell receptor beta variable 5-3 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-3A0A0A0MS03 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRBV5-3A0A0A0MS03 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms