Protein–RNA interactions for Protein: W5XKT8

SPACA6, Sperm acrosome membrane-associated protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA6W5XKT8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPACA6W5XKT8 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms