Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms