Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms