Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms