Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP164Q9UPV0 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CEP164Q9UPV0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms