Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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