Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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CPNE7Q9UBL6 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CPNE7Q9UBL6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CPNE7Q9UBL6 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CPNE7Q9UBL6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CPNE7Q9UBL6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CPNE7Q9UBL6 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CPNE7Q9UBL6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CPNE7Q9UBL6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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CPNE7Q9UBL6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CPNE7Q9UBL6 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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CPNE7Q9UBL6 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPNE7Q9UBL6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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