Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBA6

C6orf48, Protein G8, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48Q9UBA6 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms