Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms