Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms