Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC22A11Q9NSA0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms