Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTPS2Q9NRF8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS2Q9NRF8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms